Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
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CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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CHCHD4Q8N4Q1 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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