Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED9Q6R2W3 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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