Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ME3Q16798 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ME3Q16798 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms