Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SSPNQ14714 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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