Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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