Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRQ13535 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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