Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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LHX9Q9NQ69 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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LHX9Q9NQ69 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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LHX9Q9NQ69 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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LHX9Q9NQ69 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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LHX9Q9NQ69 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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LHX9Q9NQ69 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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LHX9Q9NQ69 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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LHX9Q9NQ69 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
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