Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms