Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
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CNGA3Q16281 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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CNGA3Q16281 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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CNGA3Q16281 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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CNGA3Q16281 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
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