Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
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RAB39AQ14964 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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RAB39AQ14964 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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RAB39AQ14964 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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RAB39AQ14964 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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RAB39AQ14964 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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RAB39AQ14964 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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RAB39AQ14964 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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RAB39AQ14964 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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