Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SQLEQ14534 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms