Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
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