Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RIGQ13278 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RIGQ13278 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
RIGQ13278 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
RIGQ13278 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RIGQ13278 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RIGQ13278 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RIGQ13278 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RIGQ13278 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RIGQ13278 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms