Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN7O94888 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN7O94888 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN7O94888 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN7O94888 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN7O94888 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN7O94888 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN7O94888 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN7O94888 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN7O94888 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN7O94888 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN7O94888 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN7O94888 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN7O94888 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN7O94888 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN7O94888 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN7O94888 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN7O94888 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN7O94888 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN7O94888 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN7O94888 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN7O94888 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms