Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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