Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms