Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD54Q6NXT1 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms