Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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