Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms