Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms