Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
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RAB39AQ14964 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
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RAB39AQ14964 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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RAB39AQ14964 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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RAB39AQ14964 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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