Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms