Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms