Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms