Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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PTPRCP08575 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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PTPRCP08575 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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PTPRCP08575 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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PTPRCP08575 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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