Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms