Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcniQ9Z2V9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CcniQ9Z2V9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CcniQ9Z2V9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcniQ9Z2V9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcniQ9Z2V9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcniQ9Z2V9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcniQ9Z2V9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcniQ9Z2V9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcniQ9Z2V9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CcniQ9Z2V9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcniQ9Z2V9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcniQ9Z2V9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcniQ9Z2V9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcniQ9Z2V9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcniQ9Z2V9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcniQ9Z2V9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcniQ9Z2V9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms