Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms