Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cldn7Q9Z261 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms