Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn8Q9Z260 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms