Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr4Q9Z1L2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr4Q9Z1L2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms