Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Skp2Q9Z0Z3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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