Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms