Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms