Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme3Q9WV85 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms