Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnip1Q9WUU8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms