Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms