Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scnn1bQ9WU38 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms