Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp18Q9WTV6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp18Q9WTV6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp18Q9WTV6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp18Q9WTV6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp18Q9WTV6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp18Q9WTV6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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