Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms