Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TapbpQ9R233 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TapbpQ9R233 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TapbpQ9R233 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TapbpQ9R233 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TapbpQ9R233 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TapbpQ9R233 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TapbpQ9R233 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TapbpQ9R233 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TapbpQ9R233 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TapbpQ9R233 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TapbpQ9R233 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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