Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms