Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NrkQ9R0G8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms