Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav3Q9R0C8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms