Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc6Q9R087 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc6Q9R087 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc6Q9R087 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc6Q9R087 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gpc6Q9R087 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc6Q9R087 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gpc6Q9R087 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gpc6Q9R087 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc6Q9R087 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc6Q9R087 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc6Q9R087 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc6Q9R087 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc6Q9R087 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc6Q9R087 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc6Q9R087 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc6Q9R087 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc6Q9R087 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc6Q9R087 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc6Q9R087 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc6Q9R087 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc6Q9R087 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc6Q9R087 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms