Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkab1Q9R078 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms