Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms