Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a4Q9QZR9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms