Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr4a3Q9QZB6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a3Q9QZB6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms