Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms